Fibro-Score: Fibroblastengehalt in Gewebe

Cygenia bietet mit dem Fibro-Score ein Untersuchungsverfahren an, wodurch der Anteil der Fibroblasten im Gewebe abgeschätzt werden kann.

Deconvolution 1 — Auswahl von CpGs die für Fibroblasten charakteristisch sind. Multidimensionales Scaling (MDS) des Trainingsdatensatzes (n = 409) belegt die Ähnlichkeit von DNA Methylierungsprofilen innerhalb bestimmter Zelltypen.

Fibroscore — Die DNA Methylierungswerte von zwei CpGs werden kombiniert für den FibroScore.

Literaturverweis:

Schmidt et al. Deconvolution of cellular subsets in human tissue based on targeted DNA methylation analysis at individual CpG sites. BMC Biology, 2020.