Alternsassoziierte epigenetische Veränderungen können auch anhand von Mundschleimhautabstrichen nachverfolgt werden. Unter Berücksichtigung einer Vielzahl von DNA-Methylierungsprofilen haben wir eine Epigenetische-Alters-Signatur entwickelt, die aus drei spezifischen genomischen Regionen besteht (sogenannte CpG sites). Die Methode wurde ursprünglich für Blutproben etabliert und die Berechnungen müssen für Mundabstriche angepasst werden.
Nicht-invasive Probenentnahme
DNA aus der Mundschleimhaut kann aus einem Wattetupfer isoliert werden – allerdings stammt diese DNA aus einer Mischung von Blutzellen und Mundepithelzellen. Der Anteil von Leukozyten kann dabei zwischen 5% - 60% für Mundabstriche und 16% - 95% in Speichelproben schwanken. Der Rest besteht überwiegend aus Mundepithelzellen.
Da das epigenetische Muster zwischen diesen Zelltypen sehr unterschiedlich ist können Alternsvorhersagen präzieser werden, wenn zusätzliche Information über Zelltyp-spezifische DNA Methylierung einbezogen wird. Wir haben genomische Bereiche identifiziert die eine Abschätzung des Gehaltes von Blutzellen und Mundepithelzellen erlaubt. Dadurch werden die Altersvorhersagen präziser. Allerdings ist die Genauigkeit in Blutproben weiterhin etwas überlegen.
Anwendungsgebiet
Aktuell bieten wir diesen Service ausschließlich für die Grundlagenforschung an, obwohl wir Verständnis dafür haben, dass Sie möglicherweise Interesse an der Analyse Ihres eigenen biologischen Alters haben. Zurzeit richten wir uns an Wissenschaftler und Ärzte, die den Einfluss spezifischer Parameter auf das biologische Alter genauer verstehen wollen. Es handelt sich nicht um einen zugelassenen medizinische Test und die Ergebnisse sollte daher nicht Grundlage für diagnostische oder therapeutische Entscheidungen sein.
Relevante Literatur
Han et al. New targeted approaches for epigenetic age predictions. BMC Biology 2020.
Eipel M, et al. Epigenetic age predictions based on buccal swabs are more precise in combination with cell type-specific DNA methylation signatures. Aging 2016.
Weidner C.I. et al. Aging of blood can be tracked by DNA methylation changes at just three CpG sites. Genome Biology, 2014.
Patentanmeldungen:
DE 10 2016 109 291.6 (Buccal-Cell-Signature)
2012; EP12185698.3 (Epigenetic-Aging-Signature)