Was ist Epigenetik? 

Die genetische Information der DNA wird in der Sequenz von vier Basen kodiert. Sie ist mehr oder weniger identisch in all unseren Zellen und bleibt unser Leben lang konstant. Allerdings wird die Expression bestimmter Gene für jeden spezifischen Zelltyp genau reguliert. Während der Differenzierung und Entwicklung werden einige genomische Regionen stabil aktiviert oder inaktiviert. Diese Information ist nicht in der genetischen Sequenz, sondern "epi-genetisch" durch zusätzliche Informationen auf dem DNA-Strang kodiert.  

 

Was ist DNA-Methylierung?

Inzwischen wurden viele verschiedene Arten epigenetischer Modifikationen beschrieben. Der bestuntersuchte Mechanismus ist die Addition von Methylgruppen an spezifische Cytosinbasen in der DNA-Sequenz. Dadurch wird Cytosin in 5-Methylcytosin umgewandelt. Diese Cytosine befinden sich oft in einem nachbarschaftlichen Kontext mit Guanin - sogenannte CpG sites. Es ist gängige Meinung, dass DNA-Methylierung die Genexpression runterreguliert. Das DNA-Methylierungsmuster ist sehr vielfältig, sogar innerhalb einzelner Gene. Daher hat Cygenia spezifische CpG sites herausgearbeitet, welche die bestmögliche Beschreibung des zellulären Zustandes ermöglichen. 

 

Wie wird die DNA-Methylierung analysiert?

Für die epigenetische Diagnostik ist es wichtig, höchstmögliche Präzision in der Analyse der DNA-Methylierungslevel von einzelnen CpG sites anzubieten. Zu diesem Zweck muss die DNA aus den Zellen isoliert und quantifiziert werden. Anschließend wird die DNA Bisulfit-behandelt, um Cytosin-Reste in Thymidin-Basen umzuwandeln, wohingegen die 5-Methylcytosin-Basen vor dieser Umwandlung geschützt bleiben. Das Verhältnis von Thymidin zu Cytosin ist daher ein Indikator für die DNA-Methylierung an spezifischen CpG sites. Cygenia bietet Ihnen zuverlässige Assays auf der Basis der Pyrosequenzierung oder des MassARRAY an, um die relevanten Regionen spezifisch zu analysieren. Die Resultate werden anschließend in mathematische Modelle integriert, um die Vorhersagekraft mehrerer CpG sites zu kombinieren.