Risikoabschätzung bei akuten myeloischen Leukämien

Epigenetische Aberrationen spielen eine zentrale Rolle bei der Pathophysiologie der akuten myeloischen Leukämie (AML). Vor kurzem wurde belegt, dass das DNA-Methylierungslevel an einem bestimmten CpG-Dinukleotid im Gen Complement Component 1 Subcomponent R (C1R) Rückschüsse auf den Krankheitsverlauf bei AML zulässt. Cygenia ermöglicht die Analyse des DNA-Methylierungslevels im Gen C1R für Ärzte und Wissenschaftler um einen besseren Einblick in die Entwicklung der Krankheit zu bekommen.

 

Identifikation der relevanten genomischen Region

Der genomische Bereich mit hoher prognostischer Relevanz wurde zuerst anhand eines Datensatzes von 194 DNA-Methylierungsprofilen von Patienten des “The Cancer Genome Atlas” (TCGA) identifiziert. Dabei wiesen Patienten mit einem höheren DNA-Methylierungslevel in diesem Bereich (> 27% DNAm) eine signifikant kürzere Lebenserwartung auf (53 Monate versus 11 Monate).

 

 

DNA-Methylierung in C1R ist ein prognostischer Biomarker für AML. (A) Methylierungslevel (beta-values) am relevanten CpG Dinukleotid cg08799922 (C1R) bei 656 gesunden Kontrollen (GSE40279) und 194 AML Proben (TCGA). (B) Kaplan-Meier Überlebenskurven von Patienten, die anhand des medianen DNA-Methylierungslevel bei cg08799922 stratifiziert wurden.

 

Die Ergebnisse wurden in einem unabhängigen Datensatz mit 62 DNA-Methylierungsprofilen von zytogenetisch normalen AML Patienten validiert (P= 0.009), sowie durch einen Pyrosequenzierungsassay für diesen Lokus anhand von 84 weiteren AML Proben (P= 0.012). Zudem wurde belegt, dass die DNA-Methylierung in C1R mit bestimmten Mutationen assoziiert ist. Scheinbar bietet die DNA-Methylierung in C1R einen Prognosemarker der unabhängig ist von zytogenetischen und molekularen Risiko-Scores. Es ist denkbar, dass auch ein Zusammenhang mit dem Ansprechen auf bestimmte Medikamente besteht – doch dies muss noch mit entsprechenden Studien belegt werden. Zusammengefasst bietet die Analyse des DNA-Methylierungslevels in C1R einen einfachen und kosteneffizienten Biomarker für die Prognoseabschätzung bei AML.

 

Relevante Literatur

Bozic T*, Lin Q*, et al. DNA-Methylation in C1R is a Prognostic Biomarker for Acute Myeloid Leukemia. Clinical Epigenetics. 2015; 7:116.

Patent application: 2015; EP1519142.5